天草四郎，他原本的苗字应该是益田，乃是小西行长的家臣益田好次之子。本名益田时贞，父亲益田好次是小西行长的家臣。后来时贞被过继给天草甚兵卫，改名为天草时贞。天草自小聪颖过人，有神童之称，且外表俊秀。有一位相士曾对天草说：“阁下面相尊贵，本应掌握天下，只可惜生在德川时代，难成大事。”

关原合战后小西行长被斩首，领地遭改易，家臣们纷纷四散成为浪人，据说四郎时贞从小就居住在长崎港，虔诚地信奉天主教，并向旅居日本的荷兰人学习过西洋医术——所谓神通广大，能活死人，肉白骨，大概不是完全的空穴来风吧。

且说板仓重昌来到岛原城中，集合了包括松仓胜家、锅岛胜茂、有马丰氏等周边诸侯，集合兵马，向原城发起了猛烈进攻。重昌一开始并没有把起义放在眼里，认为那些作乱的农民无拳无勇，根本不懂打仗，如何会是幕府军的对手？然而一连发起两次总攻都未能得手，己方反而损失惨重，重昌不禁涔涔汗下，意识到原城中定有深通兵法之人存在。

北九州地区乃是天主教传播的中心区域，战国后期有大量平民甚至武士都皈依了天主教，这些人在“大殉教”后都被迫潜伏了下来，趁着这次动乱再度抬头。因此固守原城的并非仅仅数万农民，其中也掺杂了很多信奉天主教的浪人——四郎时贞首先是这些浪人们的领袖。

而这个肥前、肥后两国跟萨摩国却是紧密相连，如此爆发了大规模的起义战事，幕府就算有军队也顾不上他了，而且这个时候自己领地也出现了不稳的现象，形势急转直下，迫使萨摩岛津向大明低头，开始和平谈判！

和谈对萨摩岛津来说更加是一种煎熬，每达成一条协议，萨摩自身的损失就加重一分，就好像看着比人从自己身上剜肉一般，清楚的看到那锋利的刀落下在提起，刀刀见血，寸寸到肉。

经过两个多月的谈判，大明与萨摩岛津终于达成最终的和平协议，并通过日本幕府同意正是签署，史称《鹿儿岛条约》。

鹿儿岛条约包括如下内容：

大明立刻停止对萨摩岛津的一切军事行动；萨摩岛津公开澄清琉球归属大明的事实，并且日本幕府承认大明是其宗主国，不过这一条日本幕府开始不承认，但是后来为了得到大明军事上的援助，而解决国内岛原、天草之乱，因此达成了一个秘密协定，没有对外公开。

日本萨摩藩割让吐噶剌列岛及所有附属各岛屿给大明，这些岛屿日后将属于大明琉球行省，大明将派军队进行驻守。

萨摩藩赔偿大明军费二百万两白银；另商船的损失以及船员的伤亡失踪萨摩藩也要做出相应的赔偿，并郑重向大明道歉。

萨摩藩开放鹿儿岛郡、川内为商埠，同时日本幕府也答应对大明开放长崎、福冈、日南、宫崎等九州岛中南部数个港口为商埠，并在鹿儿岛设立租界，租界区域内立法行政以及安全都将有大明负责，租界之民并享有外交豁免之权。

允许大明商人人在日本通商口岸设立领事官和工厂及输入各种机器，并且还享受低额的税收，彼此的最惠国待遇；

日本国不得逮捕为大明军队服务的人员；

吐噶剌列岛内日本国居民，两年之内任便变卖产业搬出界外，逾期未迁者，将被视为大明公民。

条约批准后两个月内，两国派员赴鹿儿岛办理移交手续。

因为条约在萨摩藩的鹿儿岛签订的，所以这份合约理所当然的就被称之为《鹿儿岛条约》。